تعود نشأة المؤسسة إلى عام 2009م عندما تكونت أول حلقة من الحلقات القرآنية، في منطقة إيدامان كوالالمبور، كامتداد لبرنامج معاذ لحفظ القرآن الكريم في اليمن الذي تأسس عام 1985م، وهو برنامج عريق يتسم بالأصالة والفاعلية في طريقته ومنهجيته، وقد تخرج منه آلاف الحفاظ والمجازين، وأثبت نجاحه في دول كثيرة، ويركز على الحفظ والتلاوة والفهم في وقت واحد.
وحرصاً على اتباع أنظمة وقوانين دولة ماليزيا فقد تم تسجيل المؤسسة تحت منظمة ماليزية مرخصة تحمل اسم ورقم:
(ITQAN EDUCATION FOUNDATION (529795-U. وتتكون المؤسسة حالياً من 54 حلقة قرآنية موزعة في سبعة مراكز لعدد 600 طالب وطالبة من 44 جنسية. تقدم المؤسسة مجموعة من البرامج القرآنية والتي أهمها برنامج الحلقات القرآنية، برنامج الإجازة والسند، برنامج تدريب الأئمة والمؤذنين وبرنامج تعليم العوام. كما تقيم المؤسسة مسابقة قرآنية سنوية على مستوى ماليزيا تشمل أيضاً مستوى الإجازة والسندات ومفردات القرآن الكريم.
وقد وقعت المؤسسة اتفاقيات تعاون مع العديد من المؤسسات القرآنية والجهات ذات العلاقة داخلياً وخارجياً.